新疆栽培杏群体遗传结构的SSR分析

园艺学报 ›› 2006, Vol. 33 ›› Issue (4): 809-812.

新疆栽培杏群体遗传结构的SSR分析

何天明^{1, 2};陈学森^1*;高疆生²;张大海³;徐麟³;吴燕¹

(¹山东农业大学果树生物学实验室, 山东泰安 271018; ²塔里木大学植物科技学院, 新疆阿拉尔843300; ³ 新疆农业科学院轮台国家果树资源圃, 新疆轮台841600)

收稿日期:2005-07-20 修回日期:2006-04-04 出版日期:2006-08-25 发布日期:2006-08-25

Using SSR Markers to Study Popula tion Genetic Structure of Cultivated Apricots Native to Xinjiang

He Tianming^{1, 2};Chen Xuesen^1*;Gao Jiangsheng²;Zhang Dahai³;Xu Lin³;Wu Yan¹

(¹Biological Lab of Pomology, Shandong Agricultural University, Tai'an, Shandong 271018, China; ²College of Plant Science and Technology, Tarim University, Alar, Xinjiang 843300, China; ³Luntai National Pomology Germplasm Garden, Academy of Agricultural Science of Xinjiang, Luntai, Xinjiang 841600, China)

Received:2005-07-20 Revised:2006-04-04 Online:2006-08-25 Published:2006-08-25

摘要/Abstract

摘要： 利用11对SSR引物对喀什、和田和库车3个新疆栽培杏( Prunus armeniaca L. ) 品种亚群进
行了分子系统学研究。结果表明: 各位点平均期望杂合度(He = 0.2364) 显示新疆栽培杏群体具有较高的遗传多样性水平。根据基因分化系数(Gst = 0.1508) 值, 新疆杏各品种亚群的遗传分化主要存在于亚群(84.9%) 内。基于Gst测得的基因流Nm 为2.3666, 人为通过种子引种可能是其基因交流的主要方式。根据果实形态和地理起源对新疆杏进行传统分类并不能完全反映出新疆杏品种间的亲缘关系。

关键词: 杏, SSR, 遗传多样性, 群体遗传学, 聚类分析

Abstract: Eleven Prunus simple sequence repeat ( SSR) primer pairs have been used in the molecular characterization of 30 apricot (Prunus armeniaca L. ) varieties from south Xinjiang Uygur Autonomous Region, China. A higher level of genetic diversity was revealed by Neips gene diversity (He = 012364). The Gst (Gene
Divergence) of 0.1508 indicated that genetic variation existed mainly within sub-group s (84.9%). The modest amount of gene flow (Nm =2.3666) based on Gst was discovered. Itwas p roposed that artificial introduction by seeds was probably the main way of gene flow. Consequently, aditional morphological and geographical classification can not completely reflect the genetic relationship between ap ricot varieties native to Xinjiang.

Key words: Apricot, SSR, Genetic diversity, Population genetics, Clustering analysis

何天明;;陈学森;高疆生;张大海;徐麟;吴燕. 新疆栽培杏群体遗传结构的SSR分析[J]. 园艺学报, 2006, 33(4): 809-812.

He Tianming;;Chen Xuesen;Gao Jiangsheng;Zhang Dahai;Xu Lin;Wu Yan. Using SSR Markers to Study Popula tion Genetic Structure of Cultivated Apricots Native to Xinjiang[J]. ACTA HORTICULTURAE SINICA, 2006, 33(4): 809-812.

[1]	王瑞, 洪文娟, 罗华, 赵丽娜, 陈颖, 王君, . 石榴品种SSR指纹图谱构建及杂种父本鉴定[J]. 园艺学报, 2023, 50(2): 265-278.
[2]	王梦梦, 孙德岭, 陈锐, 杨迎霞, 张冠, 吕明杰, 王倩, 谢添羽, 牛国保, 单晓政, 谭津, 姚星伟, . 花椰菜核心种质的构建与评价[J]. 园艺学报, 2023, 50(2): 421-431.
[3]	刘艺平, 倪梦辉, 吴芳芳, 刘红利, 贺丹, 孔德政. 荷花花器官性状与SSR标记的关联分析[J]. 园艺学报, 2023, 50(1): 103-115.
[4]	苑克俊, 牛庆霖, 秦志华, 王培久. 早熟杏新品种‘英华’[J]. 园艺学报, 2022, 49(S2): 27-28.
[5]	王艳, 左美丽, 雷经洋, 任杰, . 银杏新品种‘金贝’[J]. 园艺学报, 2022, 49(S1): 175-176.
[6]	杨秀伟, 苏江硕, 张飞, 管志勇, 房伟民, 陈发棣. 切花小菊花序开放角度的量化评价与变异分析[J]. 园艺学报, 2022, 49(8): 1723-1734.
[7]	吕正鑫, 贺艳群, 贾东峰, 黄春辉, 钟敏, 廖光联, 朱壹, 袁开昌, 刘传浩, 徐小彪. 猕猴桃种质资源表型性状遗传多样性分析[J]. 园艺学报, 2022, 49(7): 1571-1581.
[8]	李文婷, 李翠晓, 林小清, 郑永钦, 郑正, 邓晓玲. 基于STR位点对广东省柑橘溃疡病菌种群遗传结构的分析[J]. 园艺学报, 2022, 49(6): 1233-1246.
[9]	张萌, 单玉莹, 杨业波, 翟飞飞, 王兆山, 巨关升, 孙振元, 李振坚. 中国石斛属植物遗传资源的AFLP分析[J]. 园艺学报, 2022, 49(6): 1339-1350.
[10]	贡长怡, 刘姣姣, 邓强, 张立新. 茶树炭疽病病原菌鉴定及其致病性分析[J]. 园艺学报, 2022, 49(5): 1092-1101.
[11]	杨易, 黎庭耀, 李国景, 陈汉才, 沈卓, 周轩, 吴增祥, 吴新义, 张艳. 基于重测序的长豇豆基因组InDel标记开发及应用[J]. 园艺学报, 2022, 49(4): 778-790.
[12]	李超, 杨英, 陈伟, 郑贺云, 廖新福, 孙玉萍. 西州密系列甜瓜SSR指纹图谱构建及聚类分析[J]. 园艺学报, 2022, 49(3): 622-632.
[13]	聂兴华, 李伊然, 田寿乐, 王雪峰, 苏淑钗, 曹庆芹, 邢宇, 秦岭. 中国板栗品种（系）DNA指纹图谱构建及其遗传多样性分析[J]. 园艺学报, 2022, 49(11): 2313-2324.
[14]	李世帆, 邵宇纯, 祁豪男, 杨兰, 李小伟, 徐秉良, 陈雅寒. 甘肃省苹果坏死花叶病毒检测及遗传多样性分析[J]. 园艺学报, 2022, 49(11): 2431-2438.
[15]	郭鑫, 成仿云, 钟原, 成信云, 陶熙文. 紫斑牡丹花色表型数量分类研究[J]. 园艺学报, 2022, 49(1): 86-99.