园艺学报 ›› 2020, Vol. 47 ›› Issue (8): 1505-1520.doi: 10.16420/j.issn.0513-353x.2019-0933
赵 桦1,张舒婷1,刘蒲东1,付 帅1,叶 炜2,陈裕坤1,林玉玲1,徐 涵1,赖钟雄1,*
ZHAO Hua1,ZHANG Shuting1,LIU Pudong1,FU Shuai1,YE Wei2,CHEN Yukun1,LIN Yuling1,XU Han1,and LAI Zhongxiong1,*
摘要: 利用生物信息学方法对石斛组蛋白去甲基化关键酶基因JmjC进行全基因组鉴定,通过qRT-PCR检测DoJMJ组织表达模式及对不同光周期的响应。结果表明,在铁皮石斛(Dendrobium officinale)基因组上共鉴定到17个JmjC,保守结构域分析结果显示,该家族蛋白划分为5个亚家族(JARID1、JHDM3、JHDM2、JMJD6和JmjC-only),各亚家族所含保守结构域数量不等;基因结构分析发现,各亚家族的外显子和内含子数量有所差异,同一亚家族具有相似的外显子/内含子结构;启动子顺式作用元件分析发现DoJMJ家族成员启动子区域有诸多Auxin、ABA、GA、MeJA、SA等激素响应元件及光、干旱、低温、防御和胁迫等环境信号响应元件;qRT-PCR数据表明,金钗石斛(Dendrobium nobile)中该家族10个成员在茎和叶片中表达量较高,少数成员在根中的表达较高,所有成员在果实中表达均较低,推测DoJMJ主要在茎和叶片发育过程发挥作用;此外,该家族成员在不同光周期下呈现不同的表达模式,11个成员在12 h(光照)/12 h(黑暗)下表达量较高,少数成员在4 h/20 h、8 h/16 h、24 h/0 h光周期下高表达。
中图分类号: