马铃薯短花药基因sa1的定位与候选基因预测

doi:10.16420/j.issn.0513-353x.2019-0407

园艺学报 ›› 2019, Vol. 46 ›› Issue (12): 2429-2436.doi: 10.16420/j.issn.0513-353x.2019-0407

马铃薯短花药基因sa1的定位与候选基因预测

王培1，唐蝶2，李玉梅3，杨中敏4，祝光涛1，黄三文2，张春芝2,*

1云南师范大学马铃薯科学研究院，昆明 650500；2中国农业科学院深圳农业基因组研究所，广东深圳 518120； 3昆明理工大学信息工程与自动化学院，昆明 650500；4西北农林科技大学园艺学院，陕西杨凌 712100

出版日期:2019-12-25 发布日期:2019-12-25
基金资助:
云南省科技厅高端人才引进计划项目（2013HA025）；中国农业科学院科技创新工程项目

Genetic Mapping and Candidate Prediction of the sa1 Gene Controlling Anther Development in Diploid Potatoes

WANG Pei1，TANG Die2，LI Yumei3，YANG Zhongmin4，ZHU Guangtao1，HUANG Sanwen2，and ZHANG Chunzhi2,*

1The CAAS-YNNU Joint Academy of Potato Sciences，Yunnan Normal University，Kunming 650500，China；2Agricultural Genomics Institute at Shenzhen，Chinese Academy of Agricultural Sciences，Shenzhen，Guangdong 518120，China；3Faculty of Information Engineering and Automation Kunming University of Science and Technology，Kunming 650500，China；4College of Horticulture，Northwest A & F University，Yangling，Shaanxi 712100，China

Online:2019-12-25 Published:2019-12-25

摘要/Abstract

摘要： 在前期研究中，从二倍体马铃薯中鉴定了1个短花药突变体sa1，是培育不育系的良好材料。在本研究中，构建了sa1的BC1F2分离群体，通过混池测序的方法发现该性状由1个单基因控制，位于6号染色体0 ~ 33.9 Mb的区间。为了精细定位sa1，进一步扩大遗传群体，通过对重组单株进行基因型和表型分析，最终将sa1定位到1.4 Mb的区间。根据马铃薯参考基因组的注释信息，该区域包含40个基因，并通过转录组测序对候选基因进行了预测。

关键词: 马铃薯, 花药发育, BSA-seq

Abstract: In a previous study，we identified a short anther mutant sa1，which is a potential material for developing male sterile lines. In this study，we constructed a BC1F2 segregating population of sa1. By bulked segregant analysis（BSA-seq），we found this trait was controlled by a single gene which located in a 0–33.9 Mb interval on chromosome No. 6. To further map the sa1 gene，we used more BC1F2 progeny to screen the recombinants. Based on the genotype and phenotype of recombinants，the sa1 gene was narrowed to a 1.4 Mb interval. According to the annotation information of the potato reference genome，this region contains 40 genes. In addition，we predicted the candidate genes using the transcriptome data from normal and short anthers.

Key words: potato, anther development, BSA-seq

中图分类号:

S 532

王培1，唐蝶2，李玉梅3，杨中敏4，祝光涛1，黄三文2，张春芝2,*. 马铃薯短花药基因sa1的定位与候选基因预测[J]. 园艺学报, 2019, 46(12): 2429-2436.

WANG Pei1，TANG Die2，LI Yumei3，YANG Zhongmin4，ZHU Guangtao1，HUANG Sanwen2，and ZHANG Chunzhi2,*. Genetic Mapping and Candidate Prediction of the sa1 Gene Controlling Anther Development in Diploid Potatoes[J]. ACTA HORTICULTURAE SINICA, 2019, 46(12): 2429-2436.

[1]	王宽, 祁利潘, 吴桂丽, 冯琰, 王磊, 尹江, 罗亚婷, 王燕, 刘畅, 龚学臣, 王海军. 中早熟马铃薯新品种‘北方002’[J]. 园艺学报, 2022, 49(S2): 141-142.
[2]	祁利潘, 冯琰, 王磊, 尹江, 王宽, 罗亚婷, 龚学臣, 刘畅, 王燕. 马铃薯新品种‘北方004’[J]. 园艺学报, 2022, 49(S2): 143-144.
[3]	李燕山, 隋启君, 蒋伟, 杨琼芬, 白建明. 鲜食、淀粉兼用型马铃薯新品种‘云薯113’[J]. 园艺学报, 2022, 49(S2): 145-146.
[4]	邹雪, 丁凡, 刘丽芳, 余韩开宗, 陈年伟, 饶莉萍. 紫色马铃薯新品种‘绵紫芋1号’[J]. 园艺学报, 2022, 49(S1): 93-94.
[5]	闫文渊, 秦军红, 段绍光, 徐建飞, 简银巧, 金黎平, 李广存. 水氮耦合对马铃薯光合特性、块茎形成和品质的影响[J]. 园艺学报, 2022, 49(7): 1491-1504.
[6]	祁利潘, 李越, 王磊, 冯琰, 王宽, 尹江, 郭华春. 马铃薯与枸杞嫁接愈合过程的解剖学观察[J]. 园艺学报, 2022, 49(4): 868-874.
[7]	叶广继, 郑贞贞, 纳添仓, 王舰. 马铃薯资源糖苷生物碱含量评价及合成相关基因表达分析[J]. 园艺学报, 2022, 49(11): 2357-2366.
[8]	罗红玉, 杨江伟, 冯亚, 张欢欢, 刘升燕, 张宁, 司怀军. STTM技术沉默马铃薯Stu-miR156对其侧根发育的影响[J]. 园艺学报, 2021, 48(3): 531-538.
[9]	宋玉浩, 史伟玲, 张娇, 丁振宇, 彭洪娴, 蒋春燕, 马秋芹, 李芝静, 赵勇, 唐道彬, 张凯, 王季春, 刘勋. 马铃薯块茎淀粉组分高效检测体系的建立及应用[J]. 园艺学报, 2021, 48(3): 600-608.
[10]	刘程, 王世尧, 史伟玲, 宋玉浩, 蒋锐, 赵勇, 莫世春, 吕典秋, 王季春, 刘勋. 马铃薯抗晚疫病基因R8、RB和抗病毒病基因Rx1、Ry_adg的多重PCR检测[J]. 园艺学报, 2021, 48(2): 389-396.
[11]	许国春, 罗文彬, 李华伟, 许泳清, 纪荣昌, 张鸿, 邱思鑫, 汤浩. 马铃薯叶片光合效率遗传变异分析及高光效种质筛选[J]. 园艺学报, 2021, 48(11): 2239-2250.
[12]	李佩华, 彭正松, 夏明忠, 蔡光泽, 袁颖, 方志荣, 曲继鹏, 清源. 高产、抗病、广适马铃薯新品种‘西芋3号’[J]. 园艺学报, 2021, 48(10): 2115-2116.
[13]	荐红举, 万梦圆, 付毅, 丁艺, 琚熙三, 尚丽娜, 李辉, 王季春, 胡柏耿, 吕典秋. 马铃薯CHI家族基因鉴定及其对外源水杨酸和茉莉酸的响应分析[J]. 园艺学报, 2021, 48(1): 83-95.
[14]	梁静思, 祝菊澧, 徐裴, 张佩, 李灿辉, 唐唯, . 植原体及马铃薯相关病害研究进展[J]. 园艺学报, 2020, 47(9): 1777-1792.
[15]	赵喜娟 1,2，张会灵 1,*，侯娟 2,3，张菊平 1，陈苏丹 1，宋波涛 2. 过表达 SbRFP1 基因提高马铃薯组培苗的耐盐性[J]. 园艺学报, 2020, 47(2): 381-389.

马铃薯短花药基因sa1的定位与候选基因预测

Genetic Mapping and Candidate Prediction of the sa1 Gene Controlling Anther Development in Diploid Potatoes

PDF

可视化

摘要/Abstract

引用本文

使用本文

参考文献

相关文章 15

编辑推荐

Metrics

本文评价

访问总数:　当日访问总数:　当前在线人数:

马铃薯短花药基因sa1的定位与候选基因预测

Genetic Mapping and Candidate Prediction of the sa1 Gene Controlling Anther Development in Diploid Potatoes

PDF

可视化

摘要/Abstract

引用本文

使用本文

参考文献

相关文章 15

编辑推荐

Metrics

本文评价

访问总数: 当日访问总数: 当前在线人数:

访问总数:　当日访问总数:　当前在线人数: