园艺学报 ›› 2019, Vol. 46 ›› Issue (12): 2369-2382.doi: 10.16420/j.issn.0513-353x.2019-0320
温贝贝1,罗 勇1,刘冬敏1,张向娜1,李 娟1,2,3,王英姿1,2,3,王坤波1,2,3,*,黄建安1,2,3,*
WEN Beibei1,LUO Yong1,LIU Dongmin1,ZHANG Xiangna1,LI Juan1,2,3,WANG Yingzi1,2,3,WANG Kunbo1,2,3,*,and HUANG Jian’an1,2,3,*
摘要: 基于茶树基因组数据,通过生物信息学方法,对茶树全基因组TCP家族成员进行染色体定位、基因结构、编码蛋白特性和系统进化关系分析,同时采用荧光定量PCR验证茶树TCPs在不同组织部位的相对表达水平。结果表明,茶树全基因组中共鉴定出36个具有典型TCP保守结构域的转录因子基因,其CDS全长和编码氨基酸的数量分别在453 ~ 1 824 bp和150 ~ 607 aa之间,命名为CsTCP1 ~ CsTCP30。系统进化分析显示,茶树TCP转录因子家族可分为2个亚族:Class I和Class II,并可进一步分为8个亚组(A ~ H),其中Class I亚族中的TCP蛋白属于PCF或TCP-P类型,而Class II可分为CYC/TB1和CIN两种类型。基因结构和保守结构域分析结果显示,同一亚组内,TCP蛋白具有相似的氨基酸结构和保守区域,而不同亚组之间具有较大差异,暗示不同类型TCP转录因子可能具有独特的生理功能。除CsTCP21b外,其余35个CsTCP基因在茶树叶片不同生长时期均有表达,但其表达水平呈现不同趋势;荧光定量分析显示其家族成员具有组织表达特异性;外源GA3和ABA处理可以显著激活或抑制该家族基因成员的表达。
中图分类号: