葡萄MADS-box转录因子家族全基因组鉴定及表达分析

doi:10.16420/j.issn.0513-353x.2018-0842

园艺学报 ›› 2019, Vol. 46 ›› Issue (10): 1882-1896.doi: 10.16420/j.issn.0513-353x.2018-0842

葡萄MADS-box转录因子家族全基因组鉴定及表达分析

黄晓婧1，张珺1，夏惠1,2，邓群仙1，王进1,2，吕秀兰1,2，梁东1,2,*

1四川农业大学园艺学院，成都 611130；2四川农业大学果蔬研究所，成都 611130

出版日期:2019-10-25 发布日期:2019-10-25
基金资助:
四川省科技厅应用基础项目（2017JY0169）；四川省科技基础条件平台项目（18PTDJ0140，2019JDPT0009）

Genome-wide Identification and Expression Analysis of the MADS-box Gene Family in Vitis vinifera

HUANG Xiaojing1，ZHANG Jun1，XIA Hui1,2，DENG Qunxian1，WANG Jin1,2，Lü Xiulan1,2，and LIANG Dong1,2,*

1College of Horticulture，Sichuan Agricultural University，Chengdu 611130，China；2Institute of Pomology and Olericulture，Sichuan Agricultural University，Chengdu 611130，China

Online:2019-10-25 Published:2019-10-25

摘要/Abstract

摘要： 从葡萄基因组中共鉴定出54个MADS-box基因，其中Type-Ⅰ型10个，Type-Ⅱ型44个，分布于15条染色体中，编码的蛋白质序列为62 ~ 596个氨基酸，外显子数1 ~ 16个。启动子区含有大量光信号、植物激素、胁迫和分生组织等相关功能域。根据实时荧光定量RT-PCR的结果发现，SEP、FUL、FLC、SVP、SOC1和ANR1亚类基因随叶片生长表达水平逐步升高，在成熟叶中最高，衰老叶片中下降；果实第1次膨大期和果实转色期是SEP、SOC1和ANR1亚类基因的两个表达高峰期；单氰胺处理诱导SVP、AGL15、SOC1、AP3/PI、AGL12和FLC亚类基因在休眠过程中表达量持续上升，在休眠解除过程表达量下降。

关键词: 葡萄, MADS-box家族, 基因表达, 休眠, 单氰胺

Abstract: A total of 54 MADS-box genes were identified from the grape genome，including 10 Type-Ⅰand 44 Type-Ⅱgenes. All of them distributed on 15 chromosomes，encoded protein sequence was 62–596 amino acids，and the number of exons 1–16 pieces. The promoter region contains a large number of related functional domains such as light signal，plant hormone，stress and meristem. According to the results of qRT-PCR，the expression level of SEP，FUL，FLC，SVP，SOC1 and ANR1 gradually increased with the leaves growth，reaching the highest in mature leaves，then decreased in old leaves；the first fruit expansion period and fruit color change period are the two peak expression stages of SEP，SOC1 and ANR1 subclass genes；hydrogen cyanamide treatment induced the expression of SVP，AGL15，SOC1，AP3/PI，AGL12 and FLC subclass genes to increase continuously during dormancy and decrease during dormancy release.

Key words: grape, MADS-box gene family, gene expression, dormancy, hydrogen cyanamide

中图分类号:

S 663.1

黄晓婧1，张珺1，夏惠1,2，邓群仙1，王进1,2，吕秀兰1,2，梁东1,2,*. 葡萄MADS-box转录因子家族全基因组鉴定及表达分析[J]. 园艺学报, 2019, 46(10): 1882-1896.

HUANG Xiaojing1，ZHANG Jun1，XIA Hui1,2，DENG Qunxian1，WANG Jin1,2，Lü Xiulan1,2，and LIANG Dong1,2,*. Genome-wide Identification and Expression Analysis of the MADS-box Gene Family in Vitis vinifera[J]. ACTA HORTICULTURAE SINICA, 2019, 46(10): 1882-1896.

[1]	王晓晨, 聂子页, 刘先菊, 段伟, 范培格, 梁振昌, . 脱落酸对‘京香玉’葡萄果实单萜物质合成的影响[J]. 园艺学报, 2023, 50(2): 237-249.
[2]	翟含含, 翟宇杰, 田义, 张叶, 杨丽, 温陟良, 陈海江. 桃SAUR家族基因分析及PpSAUR5功能鉴定[J]. 园艺学报, 2023, 50(1): 1-14.
[3]	王宝亮, 刘凤之, 冀晓昊, 王孝娣, 史祥宾, 张艺灿, 李鹏, 王海波. 早熟鲜食葡萄新品种‘华葡早玉’[J]. 园艺学报, 2022, 49(S2): 33-34.
[4]	王宝亮, 王海波, 冀晓昊, 王孝娣, 史祥宾, 王志强, 王小龙, 刘凤之. 中熟鲜食葡萄新品种‘华葡黄玉’[J]. 园艺学报, 2022, 49(S2): 35-36.
[5]	牛早柱, 赵艳卓, 陈展, 宣立锋, 牛帅科, 魏建国, 褚凤杰, 杨丽丽. 晚熟无核葡萄新品种‘紫龙珠’[J]. 园艺学报, 2022, 49(S2): 37-38.
[6]	师校欣, 杜国强, 杨丽丽, 乔月莲, 黄成立, 王素月, 赵跃欣, 魏晓慧, 王莉, 齐向丽. 晚熟无核葡萄新品种‘红峰无核’[J]. 园艺学报, 2022, 49(S2): 39-40.
[7]	吴月燕, 陈天池, 王立如, 韩善琪, 付涛. 鲜食葡萄新品种‘甬早红’[J]. 园艺学报, 2022, 49(S2): 41-42.
[8]	王晓玥, 闫爱玲, 张国军, 王慧玲, 任建成, 刘振华, 孙磊, 徐海英, . 葡萄新品种‘瑞都晚红’[J]. 园艺学报, 2022, 49(S1): 29-30.
[9]	王勇健, 孔俊花, 范培格, 梁振昌, 金秀良, 刘布春, 代占武. 葡萄表型组高通量获取及分析方法研究进展[J]. 园艺学报, 2022, 49(8): 1815-1832.
[10]	张秋悦, 刘昌来, 于晓晶, 杨甲定, 封超年. 盐胁迫条件下杜梨叶片差异表达基因qRT-PCR内参基因筛选[J]. 园艺学报, 2022, 49(7): 1557-1570.
[11]	魏晓羽, 王跃进. 中国野生葡萄果皮解剖结构与白粉病抗性的相关性研究[J]. 园艺学报, 2022, 49(6): 1200-1212.
[12]	梁沁, 张延晖, 康开权, 刘瑾航, 李亮, 冯宇, 王超, 杨超, 李永裕. miR168家族进化特性及其在砂梨休眠期的表达模式分析[J]. 园艺学报, 2022, 49(5): 958-972.
[13]	刘众杰, 郑婷, 赵方贵, 傅伟红, 诸葛雅贤, 张志昌, 房经贵. 葡萄砧木对渗透胁迫的抗性差异及生理响应机理[J]. 园艺学报, 2022, 49(5): 984-994.
[14]	梁晨, 孙如意, 向锐, 孙艺萌, 师校欣, 杜国强, 王莉. 葡萄生长调控因子GRF家族基因的鉴定及表达分析[J]. 园艺学报, 2022, 49(5): 995-1007.
[15]	李莎莎, 玉赛赛, 傅雨恒, 骆强伟, 徐炎, 王跃进. 利用胚挽救与分子标记选育葡萄无核抗寒新种质[J]. 园艺学报, 2022, 49(4): 723-738.

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