辣椒TPS家族成员的鉴定与CaTPS1的表达分析

doi:10.16420/j.issn.0513-353x.2016-0207

园艺学报 ›› 2016, Vol. 43 ›› Issue (8): 1504-1512.doi: 10.16420/j.issn.0513-353x.2016-0207

辣椒TPS家族成员的鉴定与CaTPS1的表达分析

魏兵强^1,2，王兰兰²，张茹²，陈灵芝²，张少丽²，张建农^1,*

（¹甘肃农业大学园艺学院，兰州 730070；²甘肃省农业科学院蔬菜研究所，兰州 730070）

出版日期:2016-08-25 发布日期:2016-08-25
基金资助:
国家自然科学基金项目（31560555）；农业部园艺作物生物学与种质创制学科群西北地区蔬菜科学观测试验站项目（2015-A2621-620321-G1203-066）；甘肃省农业科学院科技创新工程学科团队项目（2015GAAS01）；甘肃省农业科学院中青年基金项目（2014GAAS27）

Identification of CaTPS Gene Family and Expression Analysis of CaTPS1 in Hot Pepper

WEI Bing-qiang^1,2，WANG Lan-lan²，ZHANG Ru²，CHEN Ling-zhi²，ZHANG Shao-li²，and ZHANG Jian-nong^1,*

（¹College of Horticulture，Gansu Agricultural University，Lanzhou 730070，China；²Institute of Vegetable，Gansu Academy of Agricultural Sciences，Lanzhou 730070，China）

Online:2016-08-25 Published:2016-08-25

摘要/Abstract

摘要：

利用生物信息学方法，从辣椒全基因组数据库中共鉴定出11个辣椒TPS基因，除CaTPS3含有1个TPS和2个TPP结构域外，其余分别含有1个TPS和1个TPP结构域。11个CaTPS分为2类，ClassⅠ包含3个基因（CaTPS1 ~ CaTPS3），分别含有16、16和13个内含子，CaTPS1和CaTPS2含Motif 1 ~ Motif 5各1个，而CaTPS3含有2个Motif 4和1个Motif 3。ClassⅡ包含8个基因（CaTPS4 ~ CaTPS11），均含有2个内含子，且分别含Motif 1 ~ Motif 6各1个。利用荧光定量PCR对CaTPS1在辣椒组织表达的特异性和低温应答模式进行分析，结果表明：CaTPS1在叶片中的表达量大约是根和茎中的5 ~ 6倍，说明CaTPS1的表达具有明显的组织特异性；低温处理后CaTPS1在根和茎中的表达高峰出现时间明显早于叶片，说明不同组织中CaTPS1对低温胁迫的应答时间存在一定差异。

关键词: 辣椒, 海藻糖–6–磷酸合成酶基因, 全基因组鉴定, 基因表达

Abstract:

Trehalose and the precursor trehalose-6-phosphate participate in responding to abiotic stress as the osmotic regulator and the signaling molecule. Trehalose-6-phosphate synthase（TPS）is one of the most important enzyme among the synthesis mechanism of trehalose-6-phosphate，and plays an important role in the metabolic pathway of trehalose. The over expression of TPS gene can improve crop’s tolerance to abiotic stress. Based on pepper genome database，11 genes of CaTPS family were identified by bioinformatics methods. Besides CaTPS3 contains one TPS and two TPP domains，the rest of 10 CaTPS family genes contain one TPS and one TPP domain. All 11 CaTPS family genes were classified into two classes according to their gene structure and phenogenesis. CaTPS1，CaTPS2 and CaTPS3 are grouped to ClassⅠ. CaTPS1 and CaTPS2 respectively contains 16 introns and 5 motifs from motif 1 to motif 5，while CaTPS3 contains 13 introns，one motif 3 and two motif 4. The rest eight genes from CaTPS4 to CaTPS11

respectively contains two introns and six motifs from motif 1 to motif 6，and they are grouped to ClassⅡ. The expression of tissue specificity and response to low temperature stress of CaTPS1 were analyzed in hot pepper using quantitative real-time PCR. The results showed that the expressive quantity of CaTPS1 gene in leaves were five to six times than that in stems and roots，this indicated that the expression of CaTPS1 appeared obvious tissue specificity in hot pepper. After treated with low temperature，the expressing peak of CaTPS1 in roots and stems appeared earlier than that in leaves，which suggested that the responding times to abiotic stress of CaTPS1 were no accordance between different tissues.

Key words: hot pepper, trehalose-6-phosphate synthase gene, genomic identification, gene expression

中图分类号:

S 641.3

魏兵强，王兰兰，张茹，陈灵芝，张少丽，张建农. 辣椒TPS家族成员的鉴定与CaTPS1的表达分析[J]. 园艺学报, 2016, 43(8): 1504-1512.

WEI Bing-qiang，WANG Lan-lan，ZHANG Ru，CHEN Ling-zhi，ZHANG Shao-li，and ZHANG Jian-nong. Identification of CaTPS Gene Family and Expression Analysis of CaTPS1 in Hot Pepper[J]. ACTA HORTICULTURAE SINICA, 2016, 43(8): 1504-1512.

[1]	王晓晨, 聂子页, 刘先菊, 段伟, 范培格, 梁振昌, . 脱落酸对‘京香玉’葡萄果实单萜物质合成的影响[J]. 园艺学报, 2023, 50(2): 237-249.
[2]	翟含含, 翟宇杰, 田义, 张叶, 杨丽, 温陟良, 陈海江. 桃SAUR家族基因分析及PpSAUR5功能鉴定[J]. 园艺学报, 2023, 50(1): 1-14.
[3]	罗海林, 袁雷, 翁华, 闫佳会, 郭青云, 王文清, 马新明. 蚕豆萎蔫病毒2号青海辣椒分离物的鉴定与全基因组序列克隆[J]. 园艺学报, 2023, 50(1): 161-169.
[4]	曹亚从, 张正海, 于海龙, 冯锡刚, 张宝玺, 王立浩. 螺丝椒新品种‘中椒409号’[J]. 园艺学报, 2022, 49(S2): 111-112.
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[6]	王永平, 胡明文, 朱文超, 廖芳芳, 白立伟, 高刚. 辣椒新品种‘红辣3号’[J]. 园艺学报, 2022, 49(S2): 115-116.
[7]	刘术均, 惠成章, 赵丽丽, 孙永生, 刘爱群. 中早熟辣椒新品种‘美罗卡’[J]. 园艺学报, 2022, 49(S2): 117-118.
[8]	王飞, 李宁, 尹延旭, 高升华, 徐凯, 姚明华. 辣椒新品种‘鄂椒红元帅’[J]. 园艺学报, 2022, 49(S2): 119-120.
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[10]	方荣, 陈学军, 周坤华, 袁欣捷, 雷刚, 黄月琴. 辣椒新品种‘赣椒18号’[J]. 园艺学报, 2022, 49(S1): 75-76.
[11]	董桑婕, 葛诗蓓, 李岚, 贺丽群, 范飞军, 齐振宇, 喻景权, 周艳虹. 不同光质补光对辣椒幼苗生长、丛枝菌根共生和磷吸收的影响[J]. 园艺学报, 2022, 49(8): 1699-1712.
[12]	李颖, 王恒明, 徐小万, 徐晓美, 黄智文. 辣椒新品种‘粤椒8号’[J]. 园艺学报, 2022, 49(8): 1837-1838.
[13]	张秋悦, 刘昌来, 于晓晶, 杨甲定, 封超年. 盐胁迫条件下杜梨叶片差异表达基因qRT-PCR内参基因筛选[J]. 园艺学报, 2022, 49(7): 1557-1570.
[14]	李平平, 张祥, 刘雨婷, 谢志和, 张芮豪, 赵凯, 吕俊恒, 王梓然, 文锦芬, 邹学校, 邓明华. 辣椒63份种质果皮颜色与呈色物质的关系[J]. 园艺学报, 2022, 49(7): 1589-1601.
[15]	邹学校, 朱凡. 辣椒的起源、进化与栽培历史[J]. 园艺学报, 2022, 49(6): 1371-1381.

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