西瓜bHLH 转录因子家族基因的鉴定及其在非生物胁迫下的表达分析

doi:10.16420/j.issn.0513-353x.2015-0886

园艺学报 ›› 2016, Vol. 43 ›› Issue (2): 281-294.doi: 10.16420/j.issn.0513-353x.2015-0886

西瓜bHLH 转录因子家族基因的鉴定及其在非生物胁迫下的表达分析

何洁，顾秀容，魏春华，杨小振，李好，马建祥，张勇，杨建强，张显*

西北农林科技大学园艺学院，陕西杨凌 712100

出版日期:2016-02-25 发布日期:2016-02-25
基金资助:
国家现代农业产业技术体系建设专项资金项目（CARS-26-18）

Identification and Expression Analysis Under Abiotic Stresses of the bHLH Transcription Factor Gene Family in Watermelon

HE Jie，GU Xiu-rong，WEI Chun-hua，YANG Xiao-zhen，LI Hao，MA Jian-xiang，ZHANG Yong， YANG Jian-qiang，and ZHANG Xian*

College of Horticulture，Northwest A & F University，Yangling，Shaanxi 712100，China

Online:2016-02-25 Published:2016-02-25

摘要/Abstract

摘要：

利用生物信息学方法，在西瓜测序基因组97103 中共鉴定出96 个bHLH 家族成员，其中有
94 个可以被定位到西瓜的11 条染色体上。通过基因结构和结构域序列保守性的预测，发现这些基因的序
列长度和内含子数量变化很大，但bHLH 结构域序列比较保守。用拟南芥中39 条已知的bHLH 蛋白序列
和西瓜的96 条bHLH 蛋白序列构建系统发育树，结果显示西瓜的bHLH 家族可以进一步被分为11 个亚
族。运用荧光定量实时PCR 技术，分析了该家族中21 个基因在西瓜响应非生物胁迫时的表达水平，结果表
明，8 个基因受低温胁迫诱导表达，13 个基因受ABA胁迫诱导表达，14 个基因受盐胁迫诱导表达。ClabHLH41
在3 种胁迫下表达量均显著增加，说明其在低温、ABA 和盐胁迫应答中可能发挥着重要作用。

关键词: 西瓜, bHLH, 全基因组鉴定, 胁迫响应, 基因表达

Key words: watermelon, bHLH, genomic identification, stress response, gene expression

中图分类号:

S 651

何洁，顾秀容，魏春华，杨小振，李好，马建祥，张勇，杨建强，张显* . 西瓜bHLH 转录因子家族基因的鉴定及其在非生物胁迫下的表达分析[J]. 园艺学报, 2016, 43(2): 281-294.

HE Jie，GU Xiu-rong，WEI Chun-hua，YANG Xiao-zhen，LI Hao，MA Jian-xiang，ZHANG Yong，YANG Jian-qiang，and ZHANG Xian*. Identification and Expression Analysis Under Abiotic Stresses of the bHLH Transcription Factor Gene Family in Watermelon[J]. ACTA HORTICULTURAE SINICA, 2016, 43(2): 281-294.

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