基于叶绿体DNA PCR-RFLP分析柿及其近缘种亲缘关系

园艺学报 ›› 2014, Vol. 41 ›› Issue (12): 2474-2480.

基于叶绿体DNA PCR-RFLP分析柿及其近缘种亲缘关系

梁晋军，梁玉琴，傅建敏

国家林业局泡桐研究开发中心，中国林业科学研究院经济林研究开发中心，郑州 450003

出版日期:2014-12-25 发布日期:2014-12-25
基金资助:
国家‘十二五’农村领域科技计划课题（2013BAD14D0502）

Genetic Relationships of Diospyros kaki and Related Diospyros Species Using Chloroplast DNA PCR-RFLP Markers

LIANG Jin-jun，LIANG Yu-qin，and FU Jian-min

China Paulownia Research Center，Non-timber Forest Research and Development Center，Chinese Academy of Forestry，Zhengzhou 450003，China

Online:2014-12-25 Published:2014-12-25

摘要/Abstract

摘要： 应用5对叶绿体DNA（cpDNA）特异引物对柿及其近缘的8个种共32个基因型的cpDNA进行PCR扩增。采用7种限制性内切酶对其扩增产物酶切位点变异分析表明，在供试柿属植物中存在丰富的种间多态性，但供试22个柿种内基因型未检测到变异位点。应用NTSYS中UPGMA法聚类和主坐标分析表明：柿与金枣柿最近缘，其次分别是油柿、云南野毛柿、浙江柿和君迁子，而与美洲柿和乌柿相距较远。野柿（浙江）为柿的变种，聚类结果也表明野柿（浙江）与柿有一定差异。

关键词: 柿, cpDNA, PCR-RFLP, 遗传多样性, 亲缘关系

Abstract: Five special primer pairs of chloroplast genome were used to amplified chloroplast DNA （cpDNA）regions in 8 Diospyros species including 32 genotypes. The products were digested by seven restriction enzymes. The results showed high interspecific cpDNA variations within the genus Diospyros. Twenty-two D. kaki genotypes were detected no visually variation in this study. D. kaki had closely relationship with‘Jinzaoshi’，followed by D. oleifera，D. artrotricha，D. lotus and D. glaucifolia，but distant from D. virginiana and D. cathayensis in diagram based on the UPGMA cluster analysis by NTSYSpc 2.10e program. Wild persimmon（Zhejiang）is a variety varietas of persimmon. The result showed that wild persimmon（Zhejiang）is not closely similar to D. kaki.

Key words: Diospyros kaki, cpDNA, PCR-RFLP, genetic diversity, genetic relationship

中图分类号:

S 665.2

梁晋军, 梁玉琴, 傅建敏. 基于叶绿体DNA PCR-RFLP分析柿及其近缘种亲缘关系[J]. 园艺学报, 2014, 41(12): 2474-2480.

LIANG Jin-Jun, LIANG Yu-Qin, FU Jian-Min. Genetic Relationships of Diospyros kaki and Related Diospyros Species Using Chloroplast DNA PCR-RFLP Markers[J]. ACTA HORTICULTURAE SINICA, 2014, 41(12): 2474-2480.

[1]	王瑞, 洪文娟, 罗华, 赵丽娜, 陈颖, 王君, . 石榴品种SSR指纹图谱构建及杂种父本鉴定[J]. 园艺学报, 2023, 50(2): 265-278.
[2]	王梦梦, 孙德岭, 陈锐, 杨迎霞, 张冠, 吕明杰, 王倩, 谢添羽, 牛国保, 单晓政, 谭津, 姚星伟, . 花椰菜核心种质的构建与评价[J]. 园艺学报, 2023, 50(2): 421-431.
[3]	张悦, 索玉静, 孙鹏, 韩卫娟, 刁松锋, 李华威, 张嘉嘉, 傅建敏, 李芳东. 柿种质资源果实形态多样性分析[J]. 园艺学报, 2022, 49(7): 1473-1490.
[4]	吕正鑫, 贺艳群, 贾东峰, 黄春辉, 钟敏, 廖光联, 朱壹, 袁开昌, 刘传浩, 徐小彪. 猕猴桃种质资源表型性状遗传多样性分析[J]. 园艺学报, 2022, 49(7): 1571-1581.
[5]	李文婷, 李翠晓, 林小清, 郑永钦, 郑正, 邓晓玲. 基于STR位点对广东省柑橘溃疡病菌种群遗传结构的分析[J]. 园艺学报, 2022, 49(6): 1233-1246.
[6]	张萌, 单玉莹, 杨业波, 翟飞飞, 王兆山, 巨关升, 孙振元, 李振坚. 中国石斛属植物遗传资源的AFLP分析[J]. 园艺学报, 2022, 49(6): 1339-1350.
[7]	杨易, 黎庭耀, 李国景, 陈汉才, 沈卓, 周轩, 吴增祥, 吴新义, 张艳. 基于重测序的长豇豆基因组InDel标记开发及应用[J]. 园艺学报, 2022, 49(4): 778-790.
[8]	杨思潮, 张萌, 张青林, 罗正荣. 中国甜柿自然脱涩特点及其机理研究进展[J]. 园艺学报, 2022, 49(12): 2659-2668.
[9]	聂兴华, 李伊然, 田寿乐, 王雪峰, 苏淑钗, 曹庆芹, 邢宇, 秦岭. 中国板栗品种（系）DNA指纹图谱构建及其遗传多样性分析[J]. 园艺学报, 2022, 49(11): 2313-2324.
[10]	李世帆, 邵宇纯, 祁豪男, 杨兰, 李小伟, 徐秉良, 陈雅寒. 甘肃省苹果坏死花叶病毒检测及遗传多样性分析[J]. 园艺学报, 2022, 49(11): 2431-2438.
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[12]	陈明堃, 陈璐, 孙维红, 马山虎, 兰思仁, 彭东辉, 刘仲健, 艾叶. 建兰种质资源遗传多样性分析及核心种质构建[J]. 园艺学报, 2022, 49(1): 175-186.
[13]	李艳红, 聂俊, 郑锦荣, 谭德龙, 张长远, 史亮亮, 谢玉明. 华南地区樱桃番茄表型性状遗传多样性分析及综合评价[J]. 园艺学报, 2021, 48(9): 1717-1730.
[14]	王鑫, 李明阳, 田琳, 刘冬云. 利用ISSR标记及rDNA-ITS序列分析河北省野生铁线莲的亲缘关系[J]. 园艺学报, 2021, 48(9): 1755-1767.
[15]	赵玉靖, 卢银, 冯大领, 罗蕾, 吴芳, 杨锐, 陈悦琦, 孙晓雪, 王彦华, 陈雪平, 申书兴, 罗双霞, 赵建军. 大白菜自交系背景选择InDel标记与重要农艺性状的关联分析[J]. 园艺学报, 2021, 48(7): 1282-1294.