基于ISSR标记的红花檵木品种亲缘关系分析

园艺学报 ›› 2014, Vol. 41 ›› Issue (2): 365-374.

基于ISSR标记的红花檵木品种亲缘关系分析

董海燕1,*，季孔庶2，侯伯鑫3，赵宏波1

（1浙江农林大学风景园林与建筑学院，浙江临安 311300；2南京林业大学林木遗传与生物技术省部共建教育部重点实验室，南京 210037；3湖南省林业科学院，长沙 410004）

收稿日期:2013-09-13 出版日期:2014-02-25 发布日期:2014-02-25

Genetic Relatives Analysis of 41 Loropetalum chinense var. rubrum Cultivars by ISSR Markers

DONG Hai-yan1,*，JI Kong-shu2，HOU Bo-xin3，and ZHAO Hong-bo1

（1College of Landscape Architecture，Zhejiang Agriculture and Forestry University，Lin’an，Zhejiang 311300，China；2Key Laboratory of Forest Genetics & Biotechnology of Ministry of Education，Nanjing Forestry University，Nanjing 210037，China；3Hunan Academy of Forestry，Changsha 410004，China）

Received:2013-09-13 Online:2014-02-25 Published:2014-02-25

摘要/Abstract

摘要： 采用ISSR分子标记技术对红花檵木41个品种的遗传多样性进行了分析。从60条ISSR引物中筛选出14条引物分别对供试材料基因组DNA进行扩增，共获得203条清晰可辨谱带，其中多态性带148条，多态位点百分率为72.9%。应用NTSYS-pc（version 2.10e）软件计算得到各品种间的Jaccard相似系数介于0.626 ~ 0.926之间。用UPGMA法将41个品种分成5个类群，支持叶色作为最高分类等级，其次应重视花瓣形状的利用，这两个性状最为稳定且能反映品种间系统演化；同时由于品种起源和选育的原因，品种分类还应适当考虑育种过程及其亲本的性状；花色、叶形、分枝性等变化没有明显规律，不宜作为太高的分类等级。

关键词: 红花檵木, ISSR, 遗传多样性, 亲缘关系

Abstract: ISSR-PCR was used to detect the genetic diversity and relationship of 41 varieties of Loropetalum chinense var. rubrum. ISSR fingerprinting amplified by 14 ISSR primers revealed a total number of 203 unambiguous bands，of which 148 ones were polymorphic and the polymorphism frequency was 72.9%. As analyzed by NTSYS-pc（version 2.10e），the similarity coefficient between varieties ranged from 0.626 to 0.926. These 41 varieties of L. chinense var. rubrum were divided into five groups by UPGMA based on Jaccard coefficient. Leaf color could be the highest classification trait following with petal shape which reflected the phylogenetic evolution among different cultivars. Additionally，due to the origin and breeding of cultivars，the breeding procedure and the characteristics of parents should be considered in cultivar classification. The inheritance of flower color，leaf shape and habit of branching was not stable，so these traits were not suitable as higher classification standard.

Key words: Loropetalum chinense var. rubrum, ISSR, genetic diversity, genetic relatives

中图分类号:

S 68

董海燕1,*，季孔庶2，侯伯鑫3，赵宏波1. 基于ISSR标记的红花檵木品种亲缘关系分析[J]. 园艺学报, 2014, 41(2): 365-374.

DONG Hai-yan1,*，JI Kong-shu2，HOU Bo-xin3，and ZHAO Hong-bo1. Genetic Relatives Analysis of 41 Loropetalum chinense var. rubrum Cultivars by ISSR Markers[J]. ACTA HORTICULTURAE SINICA, 2014, 41(2): 365-374.

[1]	王瑞, 洪文娟, 罗华, 赵丽娜, 陈颖, 王君, . 石榴品种SSR指纹图谱构建及杂种父本鉴定[J]. 园艺学报, 2023, 50(2): 265-278.
[2]	王梦梦, 孙德岭, 陈锐, 杨迎霞, 张冠, 吕明杰, 王倩, 谢添羽, 牛国保, 单晓政, 谭津, 姚星伟, . 花椰菜核心种质的构建与评价[J]. 园艺学报, 2023, 50(2): 421-431.
[3]	吕正鑫, 贺艳群, 贾东峰, 黄春辉, 钟敏, 廖光联, 朱壹, 袁开昌, 刘传浩, 徐小彪. 猕猴桃种质资源表型性状遗传多样性分析[J]. 园艺学报, 2022, 49(7): 1571-1581.
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[6]	杨易, 黎庭耀, 李国景, 陈汉才, 沈卓, 周轩, 吴增祥, 吴新义, 张艳. 基于重测序的长豇豆基因组InDel标记开发及应用[J]. 园艺学报, 2022, 49(4): 778-790.
[7]	聂兴华, 李伊然, 田寿乐, 王雪峰, 苏淑钗, 曹庆芹, 邢宇, 秦岭. 中国板栗品种（系）DNA指纹图谱构建及其遗传多样性分析[J]. 园艺学报, 2022, 49(11): 2313-2324.
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[9]	吴致君, 李伟, 王兴华, 张成, 蒋勋, 黎盛, 罗理勇, 孙康, 曾亮. 基于SLAF-seq的茶组子房室数不稳定居群种质亲缘关系分析[J]. 园艺学报, 2022, 49(11): 2455-2470.
[10]	陈明堃, 陈璐, 孙维红, 马山虎, 兰思仁, 彭东辉, 刘仲健, 艾叶. 建兰种质资源遗传多样性分析及核心种质构建[J]. 园艺学报, 2022, 49(1): 175-186.
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[12]	王鑫, 李明阳, 田琳, 刘冬云. 利用ISSR标记及rDNA-ITS序列分析河北省野生铁线莲的亲缘关系[J]. 园艺学报, 2021, 48(9): 1755-1767.
[13]	赵玉靖, 卢银, 冯大领, 罗蕾, 吴芳, 杨锐, 陈悦琦, 孙晓雪, 王彦华, 陈雪平, 申书兴, 罗双霞, 赵建军. 大白菜自交系背景选择InDel标记与重要农艺性状的关联分析[J]. 园艺学报, 2021, 48(7): 1282-1294.
[14]	赵青, 都真真, 李锡香, 宋江萍, 张晓辉, 阳文龙, 贾会霞, 王海平. 利用SSRseq分子标记的大蒜种质资源遗传多样性研究[J]. 园艺学报, 2021, 48(7): 1397-1408.
[15]	江锡兵, 章平生, 徐阳, 吴聪连, 张东北, 龚榜初, 吴开云, 赖俊声. 栗杂交F₁代SSR标记遗传多样性分析[J]. 园艺学报, 2021, 48(5): 897-907.