结球甘蓝花粉蛋白延伸因子基因的克隆及其序列分析

园艺学报 ›› 2013, Vol. 40 ›› Issue (10): 1990-1998.

结球甘蓝花粉蛋白延伸因子基因的克隆及其序列分析

王志敏，牛义*，许俊强，孙梓健，丁泽琴，杨修勤，汤青林，宋明*

（西南大学园艺园林学院，南方山地园艺学教育部重点实验室，重庆市蔬菜学重点实验室，重庆 400715）

收稿日期:2013-06-21 出版日期:2013-10-25 发布日期:2013-10-25

Cloning and Sequence Analysis of Elongation Factor EF-Tu Gene from Cabbage

WANG Zhi-min，NIU Yi*，XU Jun-qiang，SUN Zi-jian，DING Ze-qin，YANG Xiu-qin，TANG Qing-lin，and SONG Ming*

（College of Horticulture and Landscape Architecture, Southwest University；Key Laboratory of Horticulture Science for Southern Mountainous Regions，Ministry of Education；Chongqing Key Laboratory of Olericulture，Chongqing 400715，China）

Received:2013-06-21 Online:2013-10-25 Published:2013-10-25

摘要/Abstract

摘要： 以结球甘蓝（Brassica oleracea L. var. capitata L.）E1花粉为试材，对萌发前后的花粉总蛋白进行双向电泳及差异蛋白质谱分析，发现延伸因子BoEF-Tu蛋白在花粉萌发后较萌发前表达上调。利用同源克隆得到甘蓝BoEF-Tu基因的全长cDNA序列，其长度为1 728 bp，具有一个完整开放阅读框（ORF），位于112 ~ 1 473 bp处，编码453个氨基酸残基，预测分子量为49.17 kD，等电点为6.52。生物信息学分析表明：BoEF-Tu蛋白含有9个α–螺旋结构，18个β–折叠结构，不含信号肽和跨膜区，在106 ~ 121位氨基酸残基处有1个GTP结合区域（DKAPEEKKRGITIATA）。氨基酸同源性分析表明，BoEF-Tu与拟南芥EF-TuM同源性较高，达到93%；系统进化分析表明，BoEF-Tu与拟南芥EF-Tu的亲缘关系最近。

关键词: 结球甘蓝, 花粉, 延伸因子

Abstract: The elongation factor BoEF-Tu was isolated and characterized from cabbage（Brassica oleracea L. var. capitata L.）line E1 using RT-PCR and RACE-PCR after two-dimensional electrophoresis of cabbage pollen total proteins，which found that BoEF-Tu protein was upregulated when pollens were germinated. The cabbage BoEF-Tu cDNA clone contained 1 728 bp with an open reading frame（ORF）located from 112 to 1 473 bp，encoding a protein of 453 amino acids. The predicted molecular mass of BoEF-Tu was 49.17 kD with acidic pI of 6.52. Bioinformatic analysis results showed that BoEF-Tu protein might contain 9 α-helixes and 18 β-folds，and a GTP-binding signature（DKAPEEKKRGITIATA）was located from 106 to 121 amino acid residues，but had no signal peptide sequences and transmembrane region. Homology analysis of the deduced amino acids indicated that the sequences had 93% similarity with Arabidopsis thaliana EF-TuM. The phylogenetic tree showed that the BoEF-Tu had the closest genetic relationship with Arabidopsis thaliana EF-Tu.

Key words: cabbage, pollen, elongation factor

中图分类号:

S 635.1

王志敏牛义许俊强孙梓健丁泽琴杨修勤汤青林宋明. 结球甘蓝花粉蛋白延伸因子基因的克隆及其序列分析[J]. 园艺学报, 2013, 40(10): 1990-1998.

WANG Zhi-min，NIU Yi*，XU Jun-qiang，SUN Zi-jian，DING Ze-qin，YANG Xiu-qin，TANG Qing-lin，and SONG Ming*. Cloning and Sequence Analysis of Elongation Factor EF-Tu Gene from Cabbage [J]. ACTA HORTICULTURAE SINICA, 2013, 40(10): 1990-1998.

[1]	崔建, 钟雄辉, 刘泽慈, 陈登辉, 李海龙, 韩睿, 乐祥庆, 康俊根, 王超. 结球甘蓝染色体片段替换系构建[J]. 园艺学报, 2023, 50(1): 65-78.
[2]	李黎, 冯丹丹, 潘慧, 李文艺, 邓蕾, 汪祖鹏, 钟彩虹. 猕猴桃花粉灭菌方法比较及对果实品质的影响[J]. 园艺学报, 2022, 49(4): 769-777.
[3]	程世平, 姚鹏强, 耿喜宁, 刘春洋, 谢丽华. 高温诱导牡丹产生未减数花粉[J]. 园艺学报, 2022, 49(3): 581-589.
[4]	董艺, 冯羽飞, 许忠民, 王世民, 唐鸿吕, 黄炜. SSR标记遗传距离与结球甘蓝杂种优势的关系分析[J]. 园艺学报, 2021, 48(5): 934-946.
[5]	杨佳慧, 吴婷, 朱俊, 杨树华, 赵鑫, 葛红, 武荣花, 贾瑞冬. 长瓣兜兰开花特性与繁育系统研究[J]. 园艺学报, 2021, 48(5): 1002-1012.
[6]	何敏, 谷超, 吴巨友, 张绍铃. 果树自交不亲和机制研究进展[J]. 园艺学报, 2021, 48(4): 759-777.
[7]	李洪池, 吴天彧, 罗建. 西藏色季拉山区龙胆科30种植物的花粉形态特征[J]. 园艺学报, 2021, 48(12): 2427-2442.
[8]	杨丽梅, 方智远, 张扬勇, 庄木, 吕红豪, 王勇, 季家磊, 刘玉梅, 李占省, 韩风庆. 中国结球甘蓝抗病抗逆遗传育种近年研究进展[J]. 园艺学报, 2020, 47(9): 1678-1688.
[9]	田绍泽1，刘思禹1,2，王坤1，岳远征1,3，马方芳1，杨赵楠1，殷倩1，胡惠蓉1,*. 矮牵牛花发育相关基因PhTs2的克隆及功能分析[J]. 园艺学报, 2020, 47(6): 1087-1097.
[10]	王茜1,2,3，杨旭东2,4,5，夏常英1,3,4，李瑾4,5，于胜祥4,5,*. 凤仙花组（Impatiens sect. Impatiens）植物花粉形态研究[J]. 园艺学报, 2020, 47(5): 893-906.
[11]	解玮佳1,2，李世峰1，瞿素萍1，彭绿春1，张露1，杨秀梅1，王继华1,*. 常绿杜鹃不同杂种群间杂交的可育性分析[J]. 园艺学报, 2019, 46(5): 910-922.
[12]	崔慧琳1,2，李志远2，方智远2，杨丽梅2，庄木2，吕红豪2，刘玉梅2，宋江华1,，张扬勇2,. 结球甘蓝自交系YL-1的高效遗传转化体系的建立及应用[J]. 园艺学报, 2019, 46(2): 345-355.
[13]	王神云1，李建斌1,*，于利1，余方伟1，唐君1，张伟1，王红1，李华瑞2. 越冬结球甘蓝新品种‘苏甘27’[J]. 园艺学报, 2018, 45(S2): 2743-2744.
[14]	孙忆，李玺，丁苏芹，史益敏，唐东芹*. 小苍兰开花特性与繁育系统研究[J]. 园艺学报, 2018, 45(2): 299-308.
[15]	张超越，郭绍芬，孙晴，张桂芝，许俊杰，刘林. 杏花粉和花药壁发育的胚胎学特征[J]. 园艺学报, 2018, 45(12): 2427-2436.