云南蔷薇属部分种质资源的SSR遗传多样性研究

园艺学报 ›› 2008, Vol. 35 ›› Issue (8): 1227-1232.

云南蔷薇属部分种质资源的SSR遗传多样性研究

唐开学^1,2; 邱显钦²; 张颢²;李树发²;王其刚²;蹇洪英²;鄢波²;黄兴奇^1,3*

（¹云南大学生命科学学院，昆明650091；²云南省农业科学院花卉研究所，昆明 650205；³云南省农业生物技术重点实验室，昆明650223）

收稿日期:2008-04-02 修回日期:2008-07-16 出版日期:2008-08-25 发布日期:2008-08-25
通讯作者: 黄兴奇

Study on Genetic Diversity of Some Rosa Germplasm in Yunnan Based on SSR Markers

TANG Kai-xue^1,2, QIU Xian-qin², ZHANG Hao², LI Shu-fa², WANG Qi-gang², JIAN Hong-ying², YAN Bo², and HUANG Xing-qi^1,3*

(¹College of Life Sciences, Yunnan University, Kunming 650091,China；² Flower Research Institute, Yunnan Academy of Agricultural Sciences, Kunming 650205, China；³ Yunnan Key Laboratory of Agricultural Biotechnology, Kunming 650223, China)

Received:2008-04-02 Revised:2008-07-16 Online:2008-08-25 Published:2008-08-25
Contact: HUANG Xing-qi

摘要/Abstract

摘要：

利用简单重复序列SSR（Simple Sequence Repeat）标记技术对42份蔷薇属（Rosa L.）种质资源（包括13份野生种、变种、变型及29份栽培品种）的遗传多样性进行了研究。用筛选出的18对SSR引物对42份材料DNA进行PCR扩增，在18个位点共检测到148个等位基因，每一位点的等位基因变幅为6~14个，平均8.2个。材料间遗传相似系数变化范围为0.282~0.892，表明在分子水平上云南省蔷薇属植物具有丰富的遗传多样性。本研究发现，在相似系数为0.456时，基于SSR标记的聚类分析可以将 13个蔷薇野生种明显分为5个组，这与植物形态学分类结果大体一致。在遗传相似系数为0.43水平上，聚类分析将42份供试材料分为5大组群；同时初步探讨了野生种之间以及野生种与栽培品种之间的遗传亲缘关系。

关键词: 蔷薇属, 遗传多样性, 亲缘关系, SSR

Abstract: The genetic diversity of 42 Rosa germplasm including 13 accessions of wild species (varieties , forms) and 29 rose cultivars in Yunnan was studied by simple sequence repeat (SSR). Eighteen pairs of SSR primers were used in PCR amplification with genomic DNA as template. A total of 148 alleles were detected at 18 loci. The number of alleles per locus ranged from 6 to 14, with an average of 8.2. The genetic similar coefficient ranged from 0.282 to 0.892, which showed that the genetic diversity among 42 rose accessions in Yunnan was abundant based on SSR molecular markers. The 13 Rosa species could be divided into five groups obviously based on the UPGMA cluster at the similar coefficient 0.456，which is consensus of botanical morphological classification. All the species and cultivars were divided into five groups at the similar coefficient of 0.43 by UPGMA cluster. Meanwhile genetic relationships between 42 rose accessions were discussed preliminarily.

Key words: Rosa L., genetic diversity, genetic relationship, SSR

中图分类号:

S 685.12

唐开学;邱显钦;张颢;李树发;王其刚;蹇洪英;鄢波;黄兴奇;. 云南蔷薇属部分种质资源的SSR遗传多样性研究[J]. 园艺学报, 2008, 35(8): 1227-1232.

TANG Kai-xue;QIU Xian-qin;ZHANG Hao;LI Shu-fa;WANG Qi-gang;JIAN Hong-ying;YAN Bo;and HUANG Xing-qi;. Study on Genetic Diversity of Some Rosa Germplasm in Yunnan Based on SSR Markers[J]. ACTA HORTICULTURAE SINICA, 2008, 35(8): 1227-1232.

[1]	王瑞, 洪文娟, 罗华, 赵丽娜, 陈颖, 王君, . 石榴品种SSR指纹图谱构建及杂种父本鉴定[J]. 园艺学报, 2023, 50(2): 265-278.
[2]	王梦梦, 孙德岭, 陈锐, 杨迎霞, 张冠, 吕明杰, 王倩, 谢添羽, 牛国保, 单晓政, 谭津, 姚星伟, . 花椰菜核心种质的构建与评价[J]. 园艺学报, 2023, 50(2): 421-431.
[3]	刘艺平, 倪梦辉, 吴芳芳, 刘红利, 贺丹, 孔德政. 荷花花器官性状与SSR标记的关联分析[J]. 园艺学报, 2023, 50(1): 103-115.
[4]	吕正鑫, 贺艳群, 贾东峰, 黄春辉, 钟敏, 廖光联, 朱壹, 袁开昌, 刘传浩, 徐小彪. 猕猴桃种质资源表型性状遗传多样性分析[J]. 园艺学报, 2022, 49(7): 1571-1581.
[5]	李文婷, 李翠晓, 林小清, 郑永钦, 郑正, 邓晓玲. 基于STR位点对广东省柑橘溃疡病菌种群遗传结构的分析[J]. 园艺学报, 2022, 49(6): 1233-1246.
[6]	张萌, 单玉莹, 杨业波, 翟飞飞, 王兆山, 巨关升, 孙振元, 李振坚. 中国石斛属植物遗传资源的AFLP分析[J]. 园艺学报, 2022, 49(6): 1339-1350.
[7]	杨易, 黎庭耀, 李国景, 陈汉才, 沈卓, 周轩, 吴增祥, 吴新义, 张艳. 基于重测序的长豇豆基因组InDel标记开发及应用[J]. 园艺学报, 2022, 49(4): 778-790.
[8]	李超, 杨英, 陈伟, 郑贺云, 廖新福, 孙玉萍. 西州密系列甜瓜SSR指纹图谱构建及聚类分析[J]. 园艺学报, 2022, 49(3): 622-632.
[9]	聂兴华, 李伊然, 田寿乐, 王雪峰, 苏淑钗, 曹庆芹, 邢宇, 秦岭. 中国板栗品种（系）DNA指纹图谱构建及其遗传多样性分析[J]. 园艺学报, 2022, 49(11): 2313-2324.
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[12]	陈明堃, 陈璐, 孙维红, 马山虎, 兰思仁, 彭东辉, 刘仲健, 艾叶. 建兰种质资源遗传多样性分析及核心种质构建[J]. 园艺学报, 2022, 49(1): 175-186.
[13]	宋芸, 贾孟君, 曹亚萍, 李政, 贺嘉欣, 王勇飞, 张鑫瑞, 乔永刚. 连翘叶绿体基因组特征分析[J]. 园艺学报, 2022, 49(1): 187-199.
[14]	李艳红, 聂俊, 郑锦荣, 谭德龙, 张长远, 史亮亮, 谢玉明. 华南地区樱桃番茄表型性状遗传多样性分析及综合评价[J]. 园艺学报, 2021, 48(9): 1717-1730.
[15]	王鑫, 李明阳, 田琳, 刘冬云. 利用ISSR标记及rDNA-ITS序列分析河北省野生铁线莲的亲缘关系[J]. 园艺学报, 2021, 48(9): 1755-1767.