新疆杏树苹果锈果类病毒的检测与全序列分析

园艺学报 ›› 2008, Vol. 35 ›› Issue (6): 805-810.

新疆杏树苹果锈果类病毒的检测与全序列分析

赵英;牛建新*

(石河子大学农学院园艺系，新疆石河子市，832003)

收稿日期:2008-03-07 修回日期:2008-05-13 出版日期:2008-06-25 发布日期:2008-06-25
通讯作者: 牛建新

Detection and Sequencing of Apple scar skid viroid from Apricot in Xinjiang

ZHAO Ying and NIU Jian-xin*

(Department of Horticulture, Agricultural College of Shihezi University, Shihezi,Xinjiang832003，China)

Received:2008-03-07 Revised:2008-05-13 Online:2008-06-25 Published:2008-06-25
Contact: NIU Jian-xin

摘要/Abstract

摘要：

在以往研究苹果锈果类病毒ASSVd的基础上，以通过斑点杂交检测ASSVd为阳性的杏树为试验材料，利用RT-PCR技术扩增出苹果锈果类病毒全长特异片段，通过回收克隆测序，发现杏树苹果锈果类病毒基因组长为330nt，将克隆测序结果在GenBank中登录，获得10条序列，登录号为：EU031487－EU031496。在此基础上，利用原位RT-PCR检测技术，进一步证明杏树叶片中有苹果锈果类病毒存在，主要分布在细胞核中。该研究证实苹果锈果类病毒也能侵染杏树，丰富了苹果锈果类病毒的寄主。

关键词: 杏树, 苹果锈果类病毒, 斑点杂交, RT-PCR, 原位RT-PCR, 全序列分析

Abstract:

Present study was conducted based on the previous research of Apple scar skin viroid (ASSVd) for apple and pear, used material of apricot was those that showed positive signal of blot hybridization detection. Full-length special fragment of ASSVd for apricot was amplicated using RT-PCR protocol, then was recycled, cloned and sequenced. It was demonstrated that the full-length genome of ASSVd of apricot is 330 nt long (GenBank numbered with EU031477 to EU031486). The exist of ASSVd in apricots was reconfirmed by the results of In situ RT - PCR , and ASSVd mainly located in nucleolus of mesophyll cell. The fact of infecting capability of apricot enlarged the host ranges of ASSVd.

Key words: apricot, Apple scar skid viroid, blot hybridization, RT-PCR, situ RT-PCR, full length analysis

中图分类号:

S 662.2

赵英;牛建新. 新疆杏树苹果锈果类病毒的检测与全序列分析[J]. 园艺学报, 2008, 35(6): 805-810.

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