哈密瓜ACC合成酶基因cDNA的克隆及全序列分析

园艺学报 ›› 2009, Vol. 36 ›› Issue (8): 1177-1183.

哈密瓜ACC合成酶基因cDNA的克隆及全序列分析

丁群英^1,3;张瑞²;廖新福^2*;郭蔼光^1,3*

(¹西北农林科技大学生命科学学院, 陕西杨凌712100; ²新疆维吾尔自治区葡萄瓜果开发研究中心, 新疆鄯善838201; ³西北农林科技大学陕西省农业分子生物学实验室, 陕西杨凌712100)

收稿日期:2009-04-20 修回日期:2009-06-23 出版日期:2009-08-25 发布日期:2009-08-25
通讯作者: 郭蔼光;廖新福

Cloning and Sequence Analysis of cDNA Encoding for ACC Synthase fromHami Melon

DING Qun-ying^1,3;ZHANG Rui²;LIAO Xin-fu2*;GUO Ai-guang^1,3*

(¹College of Life Science, NorthwestA & F University, Yangling, Shaanxi 712100, China; ²Xinjiang Developm ent and Research Center of Grapes and Melons, Shanshan, Xinjiang 838201, China; ³ Shaanxi Key Laboratory of Molecular Biology forAgriculture,Northwest A & F University, Yangling, Shaanxi 712100, China)

Received:2009-04-20 Revised:2009-06-23 Online:2009-08-25 Published:2009-08-25
Contact: GUO Ai-guang

摘要/Abstract

摘要： 以新疆哈密瓜(Cucumis melo L. ) 幼叶为材料, 根据已报道的甜瓜ACC合成酶3(1-aminocyclopropane-1-carboxylic acid synthase, ACS) 基因片段设计特异引物, 采用RT-PCR和RACE (Rapid Amplification cDNA Ends, cDNA末端快速扩增) 等技术, 克隆得到编码哈密瓜CM e2ACS3基因的全长cDNA 序列,长1 895 bp, 编码482个氨基酸, 分子量约为54.12 kD, 等电点8.45, GenBank登录号为FJ383171。利用软件MEGA4构建进化树, 发现哈密瓜ACS3基因与黄瓜中的同类基因亲缘关系最近。哈密瓜CMe-ACS3基因的克隆及序列分析为认识此基因在甜瓜中的功能研究奠定基础。

关键词: 哈密瓜, ACC合成酶, RACE, 序列分析

Abstract: Specific primers were designed based on the reported partial sequence of melon (Cucumis melo L. ) ACS3 gene in the GenBank to clone the full-length cDNA of ACS3 gene in using RT-PCR and RACE methods. Its GenBank Accession No. is FJ383171. The length of Hamimelon ACS gene cDNA is 1 895 bp,
this gene encodes 482 amino acids, the putative molecularweight is 54.12 kD and its pI is 8.45. The phylogenetic trees constructed by software MEGA4 showed that ACS3 gene of hamimelon was closely related to that of Cucumis sativus. The cloning of ACS3 gene full-length cDNA from the Hami melon provides the basis for understanding the role of ACS3 gene in melon.

Key words: Hamimelon, ACC synthase, RACE, sequence analysis

中图分类号:

丁群英;张瑞;廖新福;郭蔼光;. 哈密瓜ACC合成酶基因cDNA的克隆及全序列分析[J]. 园艺学报, 2009, 36(8): 1177-1183.

DING Qun-ying;ZHANG Rui;LIAO Xin-fu;GUO Ai-guang;. Cloning and Sequence Analysis of cDNA Encoding for ACC Synthase fromHami Melon[J]. ACTA HORTICULTURAE SINICA, 2009, 36(8): 1177-1183.

[1]	贾瑾, 徐云龙, 周佳乐, 杨小芬, 钟永辉, 曾继吾, 洪霓, 王国平, 彭抒昂, 丁芳. ‘Cocktail’葡萄柚黄龙病菌检测及鉴定[J]. 园艺学报, 2022, 49(3): 590-596.
[2]	卜方迪, 陈俊光, 刘贞, 向本春, 申冕, 崔百明, 郑银英. 新疆蟠桃中发现油桃茎痘相关病毒和亚洲李属病毒[J]. 园艺学报, 2021, 48(1): 49-59.
[3]	魏清江，马张正，勒思，雷常玉，马巧利，辜青青. 柑橘磷酸蔗糖合酶基因 CsSPS 的鉴定和表达[J]. 园艺学报, 2020, 47(2): 334-344.
[4]	刘厚宇 1,2,3，吴敏芳 1，文晓鹏 1,*. 中国樱桃 LTR 类反转录转座子反转录酶序列的克隆和分析[J]. 园艺学报, 2020, 47(2): 355-369.
[5]	孙平平，鞠明岫，马强，李正男. 苹果茎痘病毒内蒙古分离物基因组序列和生物学特征研究[J]. 园艺学报, 2019, 46(10): 2037-2046.
[6]	高学凯，张玉喜，刘春英，窦宝磊，盖树鹏*. 牡丹SERK2基因的克隆和花芽休眠进程中细胞分裂频率分析[J]. 园艺学报, 2018, 45(3): 511-518.
[7]	肖旭峰1，张祎1，吴智明2，杨寅桂1,*. 菜薹蛋白精氨酸甲基转移酶基因BrcuPRMT5的克隆及表达分析[J]. 园艺学报, 2017, 44(6): 1181-1188.
[8]	崔甜甜，王艳娇，宾羽，李中安，周常勇，宋震*. 柑橘黄化脉明病毒基因组的长链RT-PCR扩增、克隆及序列分析[J]. 园艺学报, 2017, 44(5): 944-952.
[9]	张艳慧1，刘莹洁1，王琴1，李雪燕2，胡文召3，戴祥生4，周彦1,*. 浙江柑橘产区柑橘黄脉病毒的发生、分布与分子特性研究[J]. 园艺学报, 2017, 44(10): 1978-1984.
[10]	陈洪明1，马丹丹1，金鑫1，李太盛1，邓雨青1，刘翠花1，吴强2，李中安1,，周彦1,. 不同类型柑橘中黄脉病毒衣壳蛋白基因的保守性及复制水平[J]. 园艺学报, 2017, 44(1): 106-112.
[11]	潘亚南1,2,，韩剑1,2,，吴海波3，吉艳玲4，王纯利5，刘芳5，罗明1,2,**，张祥林6. 新疆哈密瓜病毒的DAS-ELISA检测和分子鉴定[J]. 园艺学报, 2016, 43(6): 1107-1116.
[12]	王东，李冠*. CMV新疆哈密瓜分离物的寄主反应及其cp序列分析[J]. 园艺学报, 2016, 43(10): 1961-1970.
[13]	唐萌，金鑫，周常勇，李中安，陶珍珍，周彦*. 柑橘品种对不同基因型柑橘衰退病毒的抑制及变异的影响[J]. 园艺学报, 2016, 43(1): 55-60.
[14]	林源秀, 顾欣昕, 吴宛玲, 侯艳霞, 汤浩茹. 草莓FaMDHAR和FaGR的克隆与表达分析[J]. 园艺学报, 2015, 42(7): 1241-1250.
[15]	郑亚洲，王国平，周菊芳，朱晨熹，王利平，徐文兴，洪霓. 猕猴桃病毒A和B的RT-PCR检测及分子变异初步研究[J]. 园艺学报, 2015, 42(4): 665-671.