利用抑制消减杂交技术分离辣椒细胞质雄性不育育性恢复相关EST

园艺学报 ›› 2009, Vol. 36 ›› Issue (10): 1443-1449.

利用抑制消减杂交技术分离辣椒细胞质雄性不育育性恢复相关EST

郭爽;沈火林*;杨文才;杨娟;王雯

(中国农业大学农学与生物技术学院, 北京100193)

收稿日期:2009-04-30 修回日期:2009-07-06 出版日期:2009-10-25 发布日期:2009-10-25
通讯作者: 沈火林

Isolation of Fertility Restoration-related ESTs in Pepper Cytopla smic MaleSterility Lines Using SSH

GUO Shuang;SHEN Huo-lin*; YANG Wen-cai, YANG Juan;WANG Wen

(College of Agronomy and Biotechnology, China Agricultural University, Beijing 100193,China)

Received:2009-04-30 Revised:2009-07-06 Online:2009-10-25 Published:2009-10-25
Contact: SHEN Huo-lin

摘要/Abstract

摘要： 以辣椒(Capsicum annuum L. ) 细胞质雄性不育系23A、121A, 和其相应的近等基因恢复系23C、121C为试验材料, 利用抑制消减杂交( SSH) 技术成功构建了CMS恢复基因诱导表达的消减cDNA文库。结合高密度点阵膜杂交差异筛选, 获得了282个阳性克隆。通过测序, 除去重复序列共得到175个Unique ESTs。在GenBank上进行BLAST分析, 55个EST片段未找到对应的同源序列, 可能代表了新基因;120个EST片段找到了对应的同源序列, 包括103个已知功能基因和17个未知功能基因。按照MIPS功能分类法, 将其分为14个功能组, 涉及代谢、胁迫应答、蛋白活性、转录因子、信号转导等多方面的功能。

关键词: 辣椒, 细胞质雄性不育, 恢复基因, 抑制消减杂交, 差异表达

Abstract: To isolate fertility restoration-related genes in pepper cytopasmic male sterility (CMS) lines, a forward subtracted cDNA librarywas constructed using supp ression subtractive hybridization (SSH).The cDNA of pepper CMS line 23A and 121A were used as driver and near2isogenic restorer line 23C and 121C as tester. Genes differentially exp ressed were screened using dot blot hybridization. A total of 175 non-redundant expressed sequence tags (ESTs) were identified. The genesppotential function analysis showed that 103 of these genes were homologous to known genes, and 55 could be new genes. The ESTs were sorted into 14 functional categories according to the Munich Information Center for Protein Sequences (MIPS) method.

Key words: pepper, cytoplasmicmale sterility, restorer gene, suppression subtractive hybridization, differential expression

中图分类号:

S 641.3

郭爽;沈火林;杨文才;杨娟;王雯. 利用抑制消减杂交技术分离辣椒细胞质雄性不育育性恢复相关EST[J]. 园艺学报, 2009, 36(10): 1443-1449.

GUO Shuang;SHEN Huo-lin;YANG Wen-cai;YANG Juan;WANG Wen. Isolation of Fertility Restoration-related ESTs in Pepper Cytopla smic MaleSterility Lines Using SSH[J]. ACTA HORTICULTURAE SINICA, 2009, 36(10): 1443-1449.

[1]	罗海林, 袁雷, 翁华, 闫佳会, 郭青云, 王文清, 马新明. 蚕豆萎蔫病毒2号青海辣椒分离物的鉴定与全基因组序列克隆[J]. 园艺学报, 2023, 50(1): 161-169.
[2]	曹亚从, 张正海, 于海龙, 冯锡刚, 张宝玺, 王立浩. 螺丝椒新品种‘中椒409号’[J]. 园艺学报, 2022, 49(S2): 111-112.
[3]	曹亚从, 张正海, 于海龙, 冯锡刚, 张宝玺, 王立浩. 螺丝椒抗病新品种‘中椒209号’[J]. 园艺学报, 2022, 49(S2): 113-114.
[4]	王永平, 胡明文, 朱文超, 廖芳芳, 白立伟, 高刚. 辣椒新品种‘红辣3号’[J]. 园艺学报, 2022, 49(S2): 115-116.
[5]	刘术均, 惠成章, 赵丽丽, 孙永生, 刘爱群. 中早熟辣椒新品种‘美罗卡’[J]. 园艺学报, 2022, 49(S2): 117-118.
[6]	王飞, 李宁, 尹延旭, 高升华, 徐凯, 姚明华. 辣椒新品种‘鄂椒红元帅’[J]. 园艺学报, 2022, 49(S2): 119-120.
[7]	李宁, 尹延旭, 高升华, 徐凯, 王飞, 姚明华. 辣椒新品种‘锦绣红117’[J]. 园艺学报, 2022, 49(S2): 121-122.
[8]	周娜, 陶伟林, 陆景伟, 郑阳, 胡燕, 潘晓雪. 甘蓝新品种‘渝园春印’[J]. 园艺学报, 2022, 49(S1): 65-66.
[9]	方荣, 陈学军, 周坤华, 袁欣捷, 雷刚, 黄月琴. 辣椒新品种‘赣椒18号’[J]. 园艺学报, 2022, 49(S1): 75-76.
[10]	董桑婕, 葛诗蓓, 李岚, 贺丽群, 范飞军, 齐振宇, 喻景权, 周艳虹. 不同光质补光对辣椒幼苗生长、丛枝菌根共生和磷吸收的影响[J]. 园艺学报, 2022, 49(8): 1699-1712.
[11]	李颖, 王恒明, 徐小万, 徐晓美, 黄智文. 辣椒新品种‘粤椒8号’[J]. 园艺学报, 2022, 49(8): 1837-1838.
[12]	李平平, 张祥, 刘雨婷, 谢志和, 张芮豪, 赵凯, 吕俊恒, 王梓然, 文锦芬, 邹学校, 邓明华. 辣椒63份种质果皮颜色与呈色物质的关系[J]. 园艺学报, 2022, 49(7): 1589-1601.
[13]	邹学校, 朱凡. 辣椒的起源、进化与栽培历史[J]. 园艺学报, 2022, 49(6): 1371-1381.
[14]	傅鸿妃, 聂智星, 陈建瑛. 辣椒新品种‘杭椒12’[J]. 园艺学报, 2022, 49(6): 1395-1396.
[15]	龚明霞, 赵虎, 王萌, 吴星, 赵曾菁, 何志, 黄金梅, 孟生德, 王日升. 广西辣椒病毒的sRNA深度测序和RT-PCR鉴定[J]. 园艺学报, 2022, 49(5): 1060-1072.