园艺学报 ›› 2013, Vol. 40 ›› Issue (3): 571-578.
易官美,黎建辉,王冬梅,童再康,卢泳全
YI Guan-Mei, LI Jian-Hui, WANG Dong-Mei, TONG Zai-Kang, LU Yong-Quan
摘要: 利用基因组勘测序列(GSS 序列)探讨开发南方红豆杉(Taxus wallichiana var. mairei)SSR 标记的可行性。从1 923 条GSS 序列中搜寻到184 个SSR 位点。其中二核苷酸、三核苷酸和四核苷酸重 复所占比例分别为88.6%、10.3%和1.1%。不同核苷酸在重复序列中的频率分析表明,a 和t 所出现的频 率远远高于c 和g 的频率。对所获得的184 个SSR 位点设计引物,开发出90 个候选SSR 引物。在所获 得的获选标记中选取20 对引物在南方红豆杉中进行试验检验,结果19 对(95%)SSR 引物能够获得清晰 稳定的主带,表明GSS 序列可以高效地用于开发基因组SSR 标记,这些标记将为南方红豆杉的相关研究 奠定基础。
中图分类号: